Fungal hastalıklar, bitkilerde görülen mikroskobik canlı organizmaların oluşturduğu hastalıklardır. Fungal hastalıklar, çoğu zaman bitkiler üzerinde zararlı etkiler yaratan mikroorganizmaların bitkilerdeki yayılımına neden olan hastalıklara verilen genel bir isimdir. En yaygın olarak bilinen ve bitkiler üzerinde en sık görülen fungal hastalıklar, mantarlar ve bakteriye üzerine dayalı olarak böcekler tarafından taşınan hastalıklardır.
Mantarlar, bitkilerdeki fungal hastalıkların sebebidir. Bitkilerin sağlığını bozan mantar türleri arasında kahverengi çürüklük, küf, siyah çürüklük, siyah sürgün, güney çürüklüğü, haşere hastalıkları, bitki küfleri, çürük kabuk, bitki küfleri, bitki zehirlenmesi, bitki melanomu, bitki toksinleri ve çürük dallar bulunmaktadır. Bitkiler üzerinde böcekler tarafından taşınan fungal hastalıklar arasında; bitki kurdunun çürükleri, haşere ve böceklerin yapışmasıyla bulaşan hastalıklar, çürük kabuk, bitki saranları, bitki küfleri, siyah sürgün, bitki zehirlenmesi ve bitki melanomu sayılabilir.
Fungal hastalıklar bitkiler üzerinde çeşitli zararlı etkilere neden olabilir. Bunlar arasında bitkilerde kök ve gövde çürükleri, bitkilerin yavaş büyümesi, bitkilerin renk değiştirmesi, dökülme, çürüme, kuruma, çiçeklenme ve meyve dökülmesi ve bitkilerin ölmesi sayılabilir. Fungal hastalıklar bitkileri zararlandırırken, bazen çok kötü etkilere neden olabilir. Bu tür hastalıklar bitkiler üzerinde küçük de olsa zararlı etkiler yaratmakla birlikte, bitki üretiminin azalmasına veya bitkilerin ölmesine neden olabilir. Bitki üretiminin güvenli ve verimli bir şekilde devam etmesi için fungal hastalıkların önlenmesi gerekir. Bu nedenle, fungal hastalıkların oluşumu önlemek için bitki bakımının yanı sıra bitkilerde çevresel koşulların uygun olması, bitkilerin doğru tarım teknikleriyle yetiştirilmesi ve bitkilerin bitki hastalıklarına karşı korumaya alınması gerekmektedir.